本季中，本·坦尼森与表妹格温和爷爷麦克斯继续他的夏日公路之旅，迎接新的挑战并解锁更多外星人形态。值得一提的是，本将接触到两位新外星人：Cannonbolt 和 Wildvine。坦尼森一家遭遇一个神秘生物，正在恐吓一个小镇。随着调查的深入，关于麦克斯爷爷过去的秘密逐渐浮出水面，揭露了他与一个秘密组织的联系，本从Omnitrix逃脱，成为了一个独立的个体。现在，本必须对抗这个妄图统治世界的流氓外星人。本试图拆解 Omnitrix 以了解其工作原理，但最终却导致其故障，引发混合变形。与此同时，阿尼莫博士越狱，利用 Omnitrix 的一块碎片为他的转换调制器提供动力，意图改变整个星球。